執(zhí)業(yè)藥師注冊有效時間是五年。根據(jù)最新《執(zhí)業(yè)藥師職業(yè)資格制度》第十六條,，新規(guī)規(guī)定執(zhí)業(yè)藥師注冊證有效時間從三年改為五年,，需延續(xù)的應(yīng)當(dāng)在有效時間屆滿三十日之前，向所在地區(qū)注冊管理機構(gòu)提出延續(xù)注冊申請,。

執(zhí)業(yè)藥師證書到手之后不一定要注冊,，可根據(jù)個人情況需要決定什么時候注冊。不過執(zhí)業(yè)藥師實行注冊制,，就是說考試通過只獲得執(zhí)業(yè)藥師成績合格證書是不可以執(zhí)業(yè)的,，必須等注冊后才可以上崗執(zhí)業(yè)。