雖然臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師和臨床助理醫(yī)師都為經(jīng)過全國統(tǒng)一考試，能在全國范圍內(nèi)通用的考試證書,，可是,，執(zhí)業(yè)醫(yī)師資格的含金量明顯是要超過執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師的,。

臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師的考試難度比臨床助理醫(yī)師要高，尤其是在醫(yī)學(xué)綜合筆試部分,。在相同考試時間內(nèi),，執(zhí)業(yè)醫(yī)師的筆試題題量是執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師的兩倍。執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師考試不會選取或適當減少A3型題,。由此可見,，執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師考試難度明顯降低。