雖然臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師和臨床助理醫(yī)師都為經(jīng)過(guò)全國(guó)統(tǒng)一考試,，能在全國(guó)范圍內(nèi)通用的考試證書，可是,，執(zhí)業(yè)醫(yī)師資格的含金量明顯是要超過(guò)執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師的,。

臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師的考試難度比臨床助理醫(yī)師要高，尤其是在醫(yī)學(xué)綜合筆試部分,。在相同考試時(shí)間內(nèi)，執(zhí)業(yè)醫(yī)師的筆試題題量是執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師的兩倍,。執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師考試不會(huì)選取或適當(dāng)減少A3型題,。由此可見，執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師考試難度明顯降低,。